膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中發(fā)現(xiàn)的全基因組模式可以評估患者的預(yù)期壽命

發(fā)布時間：2020-05-25 13:35:23 | 閱讀：次| 關(guān)鍵詞：

在過去的70年里，膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GBM)較常見、較具侵襲性的腦癌患者預(yù)期壽命的較佳指標(biāo)就是確診時的年齡?，F(xiàn)在，一個國際科學(xué)家團(tuán)隊(duì)已經(jīng)通過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了一個評估因子，它不僅更準(zhǔn)確，而且更具有臨床相關(guān)性:在整個腫瘤基因組

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　　在過去的70年里，膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GBM)——常見、較具侵襲性的腦癌——患者預(yù)期壽命的較佳指標(biāo)就是確診時的年齡?，F(xiàn)在，一個國際科學(xué)家團(tuán)隊(duì)已經(jīng)通過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了一個評估因子，它不僅更準(zhǔn)確，而且更具有臨床相關(guān)性:在整個腫瘤基因組的數(shù)十萬個位點(diǎn)上，DNA豐度水平或拷貝數(shù)同時發(fā)生變化的模式。

膠質(zhì)母細(xì)胞瘤

　　全基因組型的患者平均存活時間為一年。然而，沒有它的病人存活時間是正常人的三倍，平均為三年。這一結(jié)果來自于今天發(fā)表在《Applied Physics Letters應(yīng)用物理快報》(APL)生物工程雜志上的一項(xiàng)回顧性臨床試驗(yàn)。

　　評估患者的預(yù)期壽命有助于醫(yī)療決策。原則上，GBM模式可以在今天以這種方式使用。例如，當(dāng)病人的磁共振成像結(jié)果不確定時，這些信息可以幫助醫(yī)生決定是否進(jìn)行干預(yù)。

　　在此模式中,包含的信息和其他模式,我們可以發(fā)現(xiàn)通過使用相同的數(shù)學(xué)方法,可以提高格林-巴利綜合征和其他疾病的標(biāo)準(zhǔn)治療。

　　個性化醫(yī)學(xué)

　　擁有一個包含整個基因組的評估器也可以幫助藥物獲得監(jiān)管批準(zhǔn)。這是因?yàn)槿炕虻睦鄯e效應(yīng)被認(rèn)為與藥物反應(yīng)有關(guān)。

　　例如，我們希望GBM模式能在未來的臨床試驗(yàn)中識別出哪些患者將從藥物中受益。即使藥物只針對一個基因，病人對藥物的反應(yīng)也取決于整個基因組的狀態(tài)，而不僅僅是一個基因。

　　任何額外藥物的成功批準(zhǔn)都具有意義。例如，在GBM中，在過去的40年里，只有一種藥物，不能治愈GBM，從試驗(yàn)發(fā)展到標(biāo)準(zhǔn)治療。

　　GBM模式不僅評估存活，還包括已知的大多數(shù)DNA拷貝數(shù)改變，以及在發(fā)現(xiàn)GBM之前未被識別的至少同樣多的改變，包括新的可用藥靶點(diǎn)。這使得藥物開發(fā)工作可以直接聚焦于已被證明與患者預(yù)后相關(guān)的基因靶點(diǎn)。

　　發(fā)現(xiàn)患者預(yù)后和整個基因組之間的關(guān)系

　　Alter的團(tuán)隊(duì)是一個成功識別GBM腫瘤的DNA拷貝數(shù)和患者預(yù)期壽命之間的關(guān)系的團(tuán)隊(duì)，現(xiàn)在他們又進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。然而，研究人員已經(jīng)認(rèn)識到這種類型的DNA改變是癌癥的一個多世紀(jì)的標(biāo)志，并在GBM腫瘤中觀察了幾十年。

　　該團(tuán)隊(duì)通過開發(fā)和使用新的數(shù)學(xué)方法來比較和對比來自國家公開數(shù)據(jù)庫癌癥基因組圖譜(TCGA)的腫瘤和正常全基因組，揭示了這一關(guān)系。以前曾多次嘗試將腫瘤的DNA拷貝數(shù)與GBM患者的預(yù)后聯(lián)系起來，但均以失敗告終，包括以前使用其他方法對TCGA相同數(shù)據(jù)的研究。

　　這是一個包含整個腫瘤基因組的評估因子。

　　新的數(shù)學(xué)方法克服了其他方法沒有克服的三個明顯的挑戰(zhàn)。首先，他們在整個基因組的數(shù)十萬個位點(diǎn)上發(fā)現(xiàn)了一致的模式，這些位點(diǎn)有30億個核苷酸。二，他們能夠同時在腫瘤和匹配的正?；蚪M中做到這一點(diǎn)。三，他們能夠在一小群病人中這樣做，大約100人，這在臨床試驗(yàn)中是很典型的。

　　“我們的數(shù)學(xué)方法之所以成功，是因?yàn)樗鼈兪褂昧藬?shù)據(jù)集的復(fù)雜結(jié)構(gòu)，而不是像通常那樣簡化或標(biāo)準(zhǔn)化它們，”研究人員表示。“這使得僅在腫瘤基因組中發(fā)生的模式與在正常細(xì)胞基因組中發(fā)生的模式以及由實(shí)驗(yàn)不一致性引起的變異得以分離。”

　　這些方法可以用于任何類型的數(shù)據(jù)，生物或其他。因此，它們可以用于為各種健康狀況(包括傳染病)提供個性化的治療方法。

　　膠質(zhì)母細(xì)胞瘤如何提高預(yù)期壽命？

　　對于膠質(zhì)母細(xì)胞的治療，巴特朗菲教授表示，手術(shù)切除仍然是主要手段。在通過活組織檢查或影像學(xué)檢查確診后，切除膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的治療方法包括盡可能多地切除腫瘤。然而，由于這種癌癥會進(jìn)入腦組織，所以一般不可能全部切除。因此，還需要額外的治療，如放療、靶向藥物治療和/或化療。

　　在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤切除手術(shù)后，復(fù)發(fā)一般是難以避免的。對于復(fù)發(fā)后的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤，再次手術(shù)仍然是首要選擇。即使考慮到腦外科手術(shù)的危險，包括神經(jīng)損傷或死亡的風(fēng)險，再次手術(shù)也是膠質(zhì)母細(xì)胞瘤復(fù)發(fā)后的主要選擇。

膠質(zhì)母細(xì)胞瘤案例

　　巴特朗菲教授腦干彌漫性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤案例一則

　　研究表明，膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者想要長期生存多次手術(shù)是必要的

　　另外相關(guān)研究表明，接受多次手術(shù)的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者與那些只做一次手術(shù)的人相比，他們可能活得更久。“我們不愿意多次給腦癌患者做手術(shù)，因?yàn)槲覀兒ε鲁霈F(xiàn)新的神經(jīng)功能缺陷或傷口愈合不良，很多時候我們對這些病人的生存機(jī)會感到悲觀，”Alfredo Quinones說，“但是這項(xiàng)研究告訴我們，手術(shù)越多，他們存活的時間就越長。我們不應(yīng)該放棄這些病人。”

　　在這項(xiàng)研究中，Quinones-Hinojosa和他的團(tuán)隊(duì)回顧了1997年至2007年接受手術(shù)切除膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的578名患者的記錄。在較后隨訪中，354例患者進(jìn)行了一次手術(shù)，168例進(jìn)行了兩次手術(shù)，41例和15例分別進(jìn)行了3次和4次手術(shù)。接受1、2、3和4次手術(shù)的患者的中位生存期分別為6.8個月、15.5個月、22.4個月和26.6個月。

　　Quinones-Hinojosa警告說，他的分析也可能高估了基于病人選擇的多種手術(shù)的價值，而且有可能那些做得更好的病人，其腫瘤的生物學(xué)特性使他們更容易活得更長。進(jìn)一步的研究需要證實(shí)他更的結(jié)論。

　　對于膠質(zhì)母細(xì)胞瘤重復(fù)手術(shù)，國際顱底腫瘤手術(shù)教授巴特朗菲教授表示，隨著腫瘤體積的縮小，重復(fù)手術(shù)也可能增加放療和化療的療效。每一次連續(xù)的手術(shù)，手術(shù)本身在技術(shù)上就變得更具挑戰(zhàn)性，因?yàn)榻馄式Y(jié)構(gòu)的改變，血管被損害，組織變得脆弱。

　　INC國際神經(jīng)外科醫(yī)生集團(tuán)提醒：膠質(zhì)母細(xì)胞瘤想要延長生存期，一次手術(shù)的選擇至關(guān)重要。高切除率的無神經(jīng)功能損傷手術(shù)能夠延長復(fù)發(fā)周期。因此，選擇技術(shù)高超的神經(jīng)外科醫(yī)生團(tuán)隊(duì)以及前沿的神經(jīng)外科設(shè)備缺一不可。